どれがいいのかは個別に判断します。

マイホーム売却時に利益が出ている場合には、3000万円控除+軽減税率の特例の適用を受けるか、買換特例の適用を受けるかどちらかを選ぶことになります。もちろん、その前に特例の条件を満たしている必要がありますが。。。

選ぶ際のポイントですが、新たに購入したマイホーム（売却をしたマイホームではありません。）を10年超保有する予定があるかどうかというのがポイントになります。

新たに購入したマイホームを10年超保有するのであれば、その新たなマイホームを将来売却する際に再度買換特例の適用を受けることができます。

新たに購入したマイホームを短期で売却した場合には、高い税率で課税されてしまいますので、今回の売却益を繰延べるよりは、3000万円控除と軽減税率の特例で一旦売却益を精算しておくことが有利となる場合が多いです。

いずれにしても個別のケースでそれぞれシミュレーションして判断することになります。実際には、これに新たに購入したマイホームの住宅ローン控除の適用についても考える必要があるため、複雑です。
住宅売却益が出る場合には、3つの選択肢の内どれを選択をするのか判断擦る必要があるため、専門家に相談されることをおすすめします。